El Shindo Muso ryu es el estilo mas conocido de manejo de Jo (Jojutsu). Fue creado por el año de 1605 por el samurai Muso Gonnosuke Katsuyoshi. Con el pasar de los siglos el Shindo Muso Ryu agrego otros estilos, manteniendo vivas algunas de las mas raras técnicas de los samuráis, volviéndose uno de los mas importantes y tradicionales estilos de kobudo que existen hoy día.
La historia del Shindo Muso Ryu esta directamente ligada al encuentro que Muso Gonnosuke tuvo con el famoso samurai Miyamoto Musashi.
Los samuráis se encontraron en la ciudad de Edo (actual Tokio) en 1605. Así como Musashi, Gonnosuke venía hace años haciendo Musha Shugyo, peregrinación por Japón en busca de la perfección. En su Shugyo, Gonnosuke lucho con el padre de Musashi, Shinmem Munisai. Tal vez por este motivo haya escogido confrontar también a su hijo.
Existen diversos relatos que narran este duelo. Se cree que Miyamoto Musashi uso una espada de madera, en cuanto Gonnosuke una espada larga. Los detalles del combate no son claros, Pero es verdad que fue la primera vez en su Musha Shugyo, Gonnosuke conoció la derrota.
La derrota contra Musashi tuvo un gran impacto en Gonnosuke. El decidió aislarse en un templo donde se quedo practicando, orando y meditando sobre como vencer la espada de Musashi. En el 37vo día de aislamiento recibió su respuesta en la forma de un sueño.
En este sueño un niño le decía a el “maruki wo motte, suigetsu wo shire”, o sea, "Tome un bastón redondo y descubra el suigetsu" Suigetsu significa literalmente "la luna sobre el agua" y se refiere al plexo solar, un punto vital usado en muchas tradiciones marciales.
Como resultado, Gonnosuke creo el Jo, un bastón de madera cuya medida 4 shakus, 2 sun y 1 bu (aproximadamente 1,28 mts)
se mantiene hasta hoy día en las armas usadas en el estilo. Gonnosuke creyó que con este bastón conseguiría vencer a Musashi.
No está claro en los registros históricos si Gonnosuke consiguió luchar nuevamente con Musashi. La tradición de Shindo Muso Ryu relata un segundo combate en el cual Gonnosuke habría conseguido equilibrar fuerzas con Musashi Sensei. De acuerdo con el folclore de este segundo combate, los dos samuráis Lo habrían considerado un empate, dado el resultado del duelo anterior.
Muso Gonnosuke posteriormente se volvió un vasallo del Clan Kuroda. Fue allá que el Shindo Muso Ryu permaneció hasta el final de la era de los Samuráis. A lo largo de las generaciones, otros estilos de Kobudo fueron siendo incluidos en el Shindo Muso Ryu como Fuzoku ryuha, o sea, artes auxiliares. Estos estilos son: